Научные сотрудники лаборатории эпигенетики ФГБНУ «МГНЦ» предложили метод диагностики на основе оценки степени метилирования генов. Метод позволит предсказать, будет ли химиотерапия эффективна в каждом конкретном случае или же станет напрасной тратой времени.
Каждая опухоль индивидуальна, имеет собственную генетическую структуру. Именно поэтому разработки генетиков имеют решающее значение для создания наиболее эффективных подходов борьбы с онкологическими заболеваниями. Исследование лаборатории эпигенетики ФГБНУ «МГНЦ» поддержано грантом РНФ.
Метилирование – это присоединение химических веществ, метильных групп, к участкам генов, которое «выключает» их из работы. Метилирование влияет на работу генома, не нарушая его структуры. В лаборатории эпигенетики МГНЦ доказали: по степени метилирования определенных генов можно прогнозировать реакцию опухоли на химиотерапию.
Первый вариант прогностической панели исследователи представили в 2019 году, он включал 12 генов. Однако главная ценность любой диагностики – высокая точность при относительно небольшом количестве биомаркеров. Новая панель включает всего три гена.
Владимир Стрельников, доктор биологических наук, заведующий лабораторией эпигенетики ФГБНУ «МГНЦ»: «Нам удалось показать, что эти биомаркеры являются наиболее информативными, имеют наибольшую прогностическую ценность. Диагностическая точность новой панели составляет75% при чувствительности 75% и специфичности 75%. Никакой другой способ сегодня не имеет такой высокой предсказательной способности. Однако эта методика не может стать самостоятельным тестом, она должна использоваться в совокупности с уже применяемыми методами прогноза».
Минимальный набор информативных биомаркеров сократит срок проведения анализа и сделает внедрение нового метода менее затратным. Анализ, основанный на степени метилирования генов, в перспективе можно будет проводить на уже имеющемся в клинико-диагностических лабораториях оборудовании, без дорогостоящих секвенаторов. Владимир Стрельников, доктор биологических наук, заведующий лабораторией эпигенетики ФГБНУ «МГНЦ»: «В любом случае перед назначением неоадъювантной химиотерапии проводится биопсия опухоли. На том же материале опухоли можно провести анализ трех маркеров метилирования, который даст дополнительную информацию, позволяющую предсказать чувствительность опухоли к неоадъювантной химиотерапии. Наша работа – одна из первых такого рода в мире».
Исследователи подчеркивают, что результаты требуют валидации на выборках большего объема. Для этого необходимо тесное сотрудничество с онкологическими центрами. Если его механизмы будут отлажены, следующая работа будет иметь уровень доказательной медицины, станет предвестником внедрения перспективного метода в практику.
