Вирус «поцелуйных клопов» оказался предком гепатита А

Вирус «поцелуйных клопов» оказался предком гепатита А

Американские генетики выяснили, что человеческий вирус гепатита А похож не на другие вирусы гепатита, а на вирус триатомовых, или «поцелуйных» клопов (подсемейство Triatominae). Ученые предполагают, что клопы были изначальными хозяевами предкового вируса, который затем перекинулся на летучих мышей, а от них — на грызунов, обезьян и людей. Исследование опубликовано в журнале Microbiology Open.
 122 •
  0
04.12.2019
CDC / Betty Partin

Гепатит у человека может быть вызван размножением нескольких вирусов, и все они используют разные стратегии размножения. Вирусы гепатита A, C и Е содержат смысловую РНК-цепь, но относятся к разным семействам — пикорнавирусов, флавивирусов и герпесвирусов соответственно. Вирус гепатита D несет антисмысловую цепь РНК, а вирус гепатита В и вовсе принадлежит к ретровирусам. Подобное разнообразие строения говорит о том, что, несмотря на общую мишень в организме человека, эти вирусы едва ли родственны друг другу.

Чтобы это проверить, группа ученых под руководством Давида Ассери (David Ussery) из Университета медицинских наук в Арканзасе сравнила геномы вирусов гепатита А, С и Е и их ближайших родственников. В распоряжении исследователей было 134 генома разных разновидностей вируса гепатита А, 2542 варианта вируса гепатита С и 557 — гепатита Е. Построив филогенетические деревья внутри каждой из групп, ученые обнаружили, что вирусы гепатита А гораздо менее разнообразны, чем вирусы гепатита С и Е.

Филогенетические деревья вирусов гепатита А, С и Е

Wassenaar et al. / Microbiology open, 2019

Затем ученые проанализировали использование вирусами разных кодонов. Так как генетический код избыточен, одну и ту же аминокислоту можно закодировать 1–6 наборами нуклеотидов, и этот признак тоже может служить показателем родства: если два организма или вируса используют сходный набор кодонов для определенных аминокислот, можно заподозрить у них общее происхождение.

Исследователи обнаружили, что вирус гепатита А отличается по набору используемых кодонов не только от вирусов гепатита С и Е, но и от своего хозяина-человека. С одной стороны, для вируса это должно быть невыгодно, потому что различие в генетическом коде может замедлять синтез вирусных белков в клетке хозяина. С другой стороны, ученые заметили, что различия довольно слабые — в основном в третьей (последней) букве кодона, на которую клеточная машина синтеза белка обращает меньше всего внимания. Поэтому такое расхождение в предпочитаемых кодонах не должно всерьез сказаться на успехе вирусной инфекции.