Материалом для выборки послужили данные долгосрочных исследований TZL (Taizhou Longitudinal Study). В проекте TZL участвовало около 120 тысяч здоровых людей из китайского города Тайчжоу с населением 1,8 млн человек. У них отбирались образцы плазмы для длительного хранения, и через несколько лет проводился мониторинг по диагностированным случаям рака. Такой обширный банк материала позволяет проводить ретроспективный анализ образцов крови и искать какие-либо признаки, скоррелированные с будущим развитием рака.
Отделение биоинженерии Калифорнийского университета более десяти лет разрабатывает методы выявления рака на основе биологического процесса, называемого анализом метилирования ДНК. Метод проверяет определённую сигнатуру ДНК, называемую CpG-метилированием, которая представляет собой добавление метильных групп к множественным смежным последовательностям CG в молекуле ДНК. Каждая ткань в организме может быть идентифицирована по уникальной сигнатуре гаплотипов метилирования.
Исследователи выполнили ретроспективный анализ образцов крови 605 бессимптомных участников обзора TZL, у 191 из которых впоследствии по стандартным протоколам диагностировали один из пяти видов рака — рак пищевода, прямой кишки, печени, лёгких или желудка. Это позволило авторам определить в крови маркеры раннего развития рака и разработать на их основе тест. Методика, названная PanSeer, способна определить эти распространённые виды рака по ранним маркерам, с диагнозом, поставленным через несколько лет, а также правильно выявить соответствующие признаки у пациентов с уже подтверждённым диагнозом.
Для определения точности нового теста, то есть его чувствительности и специфичности (показатели, важные для любой методики диагностики и определяющие долю «ложных срабатываний» и «пропуска цели») исследователи также проверили образцы плазмы у 223 пациентов с диагностированным раком и ещё 200 образцов опухолевой и здоровой ткани. Тест способен определить раковую ДНК в крови бессимптомных пациентов с чувствительностью 95% (чем выше этот показатель, тем ниже вероятность «пропуска цели»). Признаки рака, таким образом, выявляются до четырёх лет раньше, чем их обнаруживают используемые сейчас методики. В итоге статистический анализ данных показал, что чувствительность нового метода составляет 88% со специфичностью 96% у пациентов с диагностированным раком, а в 95% случаев он позволяет выявлять заболевание по ранним маркерам у пациентов без симптомов на момент взятия крови.
Однако методика не позволяет различить по фрагментам ДНК, какой из пяти видов рака у пациента, для этого требуется дополнительная диагностика. Кроме того, необходимо понимать, что анализ PanSeer также не может предсказать, у кого может развиться рак в будущем. Он выявляет пациентов, у которых уже есть раковые образования, но современные методы обнаружения их не выявляют. Также в комментариях для прессы авторы специально оговаривают: на современном этапе развития медицины никакие методики, основанные на анализах крови не способны заменить стандартные скрининговые исследования, прописанные в медицинских протоколах. Однако предполагается, что даже сейчас они могут помочь в диагностировании некоторых трудно выявляемых типов рака, в частности, рака печени и желудка.
Ближайшая цель теперь — организация мониторинга определённых категорий населения, находящихся в группах риска в силу возраста, семейной истории заболеваний или других факторов. Авторы надеются, что разработанный ими тест будет широко востребован для раннего скрининга пяти самых распространённых типов рака.
Источник: 22century.ru