Команда Джеффри Клко, соавтора исследования, оценила генетические данные 136 пациентов, проходивших лечение в больнице Святого Иуды по поводу рецидива ОМЛ. В ходе анализа была выявлена тандемная дупликация 13 экзона в гене UBTF (UBTF-tandem duplication). Она встречалась примерно в 10% случаев рецидива ОМЛ у детей. «Мы считаем, что это новый подтип детского ОМЛ», – сообщил Клко.
«Нам необходимо было настроить вычислительный пайплайн (программное обеспечение, позволяющее проводить основные этапы обработки данных высокопроизводительного секвенирования) для обнаружения генных слияний и инделов (инсерционно-делеционные мутации)», – рассказал Клко. Первый пайплайн смог выявить некоторые мутации, но не все. Несмотря на то, что исследователи в течение многих лет проводили секвенирование образцов опухоли, взятых у пациентов с рецидивами ОМЛ, вариант UBTF-TD зачастую не удавалось обнаружить. «Мы выяснили, что эта мутация встречается гораздо чаще, чем изначально предполагалось», – объясняет Клко. После изучения выборки из исследования TARGET AML (крупнейшее диагностическое исследование ОМЛ у детей) команда обнаружила большое количество пропущенных случаев.
По словам ученых, UBTF-TD чаще выявляется при ОМЛ у детей, чем у взрослых. «Примерно у 4% детей с диагнозом острый миелоидный лейкоз имеется эта мутация», – заявил Клко. При этом ученый подчеркнул, что данный вариант не встречается при ОМЛ с другими драйверными мутациями.
Когда исследователи расширили выборку, они обнаружили, что UBTF-TD при остром миелоидном лейкозе также коррелирует с более неблагоприятными исходами и повышенной частотой возникновения минимальной остаточной болезни (МОБ). МОБ связана с сохранением небольшого количества раковых клеток после первого курса лечения, что часто приводит к рецидиву рака.
Ранее была выявлена связь неблагоприятных исходов с наличием FLT3-ITD (FLT3-internal tandem duplication). Это одна из наиболее распространенных мутаций при ОМЛ у детей. «Мы предполагаем, что многие из этих случаев связаны с тандемными дупликациями UBTF», – добавляет Клко.
По мнению ученых, поиск UBTF-TD при постановке диагноза может помочь выявить пациентов с высоким риском возникновения рецидива. «Я считаю, что эта мутация станет одним из молекулярных маркеров высокого риска рецидива ОМЛ у детей, – сообщил Клко. – Если у пациента диагностируется UBTF-TD, значит требуется более интенсивная терапия на ранней стадии, в том числе трансплантация костного мозга».
Источник: evogenlab.ru
