Нейросеть научили искать левозакрученную ДНК

Нейросеть научили искать левозакрученную ДНК

Российские биоинформатики создали нейросетевой алгоритм, который может распознавать фрагменты так называемой Z-ДНК – участки ее спирали, которые закручены не вправо, а влево. Их «перепись» в геноме человека поможет узнать их роль в жизни клеток, пишет пресс-служба НИУ ВШЭ. Результаты исследования опубликовал научный журнал Scientific Reports.
 400 • 19.12.2020

Геном человека и всех остальных многоклеточных животных представляет собой набор из нескольких хромосом – длинных нитей ДНК, которые упакованы внутри ядра клетки. Долгое время биологи считали, что все молекулы ДНК – это спирали, закрученные вправо. Однако еще в конце прошлого века анализ трехмерной структуры генома показал, что это правило соблюдается далеко не всегда.

В частности, некоторые участки хромосом оказались закручены влево. Для подобных сегментов геном биологи стали использовать термин Z-ДНК. Те части хромосом, которые закручены вправо, начали называть B-ДНК. В последние годы Z-ДНК начала привлекать много внимания со стороны ученых, так как она может быть связана с некоторыми опасными заболеваниями, такими как рак, диабет и болезнь Альцгеймера.

Изучение функций левозакрученной ДНК осложняется тем, что у ученых пока нет точных представлений о том, как часто подобные сегменты встречаются внутри хромосом, что управляет их формированием и как может меняться их структура с течением времени. Это связано как с большими размерами генома, так и со сложностями в поиске участков Z-ДНК.

Геном человека и всех остальных многоклеточных животных представляет собой набор из нескольких хромосом – длинных нитей ДНК, которые упакованы внутри ядра клетки. Долгое время биологи считали, что все молекулы ДНК – это спирали, закрученные вправо. Однако еще в конце прошлого века анализ трехмерной структуры генома показал, что это правило соблюдается далеко не всегда.

В частности, некоторые участки хромосом оказались закручены влево. Для подобных сегментов геном биологи стали использовать термин Z-ДНК. Те части хромосом, которые закручены вправо, начали называть B-ДНК. В последние годы Z-ДНК начала привлекать много внимания со стороны ученых, так как она может быть связана с некоторыми опасными заболеваниями, такими как рак, диабет и болезнь Альцгеймера.

Изучение функций левозакрученной ДНК осложняется тем, что у ученых пока нет точных представлений о том, как часто подобные сегменты встречаются внутри хромосом, что управляет их формированием и как может меняться их структура с течением времени. Это связано как с большими размерами генома, так и со сложностями в поиске участков Z-ДНК.

Источник: nauka.tass.ru

Партнеры

Все партнеры